企业微信教育版新导入的家长列表会覆盖旧列表吗？

不会直接全部覆盖。
已导入的家长列表以每个条目的“学生姓名+手机号”为唯一识别码。新导入的Excel列表和已导入列表中识别码相同的条目，会被新列表的信息覆盖；若出现新的识别码，则新增一条信息。